Иногда бывает такое, если слишком много намутил и наставил разных способов наложения слоев, то потом сводишь в один опа, что - то поменялось. Попробуй просто создать новый с самого верха и нажми Shift+Ctrl+Alt+E. В новом слое все слепиться так, как ты видишь без изменений.
