Наткнулся на тему, вспомнил.
У меня такая же история была. 40d+580exII.
Сразу после покупки обратил внимание. Тестировал и фокусируясь по глазу, и на тестовой шкале - с включенной подсветкой ГРИП чуть назад уезжала.
Точка фокусировки не в ее центре оказывалась, а на передней границе (с выключенной - стабильно в центре).
Объяснения не нахожу, однако факт. Даже в сервис звонил (ну мало-ли), однако там тоже удивлялись. :D
Где-то через неделю попробовал еще раз на скорую руку, и вроде нормально было... :confused: В общем забил я на это, однако подсветку держу выключенной с того времени.

Надо будет еще раз попробовать.
Про юстировку вспышки забавно.